Projets et collaborations
Le Centre canadien de génomique computationnelle (C3G) dirige et soutient de nombreux projets d’envergure, allant de leur conception à leur déploiement. Cela comprend le développement de solutions logicielles, telles que des API et des applications web, ainsi que la facilitation de l’organisation, de la découverte et de la visualisation des données, tant pour les projets de grande que de petite envergure.
Bibliothèque génomique pancanadienne (BGPC)
Financée par les Instituts de recherche en santé du Canada et dirigée par une équipe exceptionnelle de généticiens canadiens, la Bibliothèque génomique pancanadienne (BGPC) établit un cadre national pour la gestion et le partage des données génomiques humaines au Canada.
GenPipes
GenPipes a été développé au C3G comme un cadre flexible basé sur Python qui facilite le développement et le déploiement de flux de travail à multiples étapes, optimisés pour les grappes de calcul haute performance (HPC) ainsi que pour l’infonuagique. GenPipes est fourni avec 12 pipelines validés et évolutifs couvrant diverses applications en génomique, notamment : RNA‑seq, WGS, WES, ChIP‑seq et Hi‑C.
SecureData4Health (SD4H)
SecureData4Health (SD4H) est une infrastructure infonuagique sécurisée qui permet aux chercheur·euse·s de stocker, d’accéder, de partager et d’analyser des données à n’importe quelle échelle, dans un environnement entièrement gouverné et hautement sécurisé, conservant le plein contrôle sur leurs données en tout temps. Ce projet s’appuie sur le succès du nuage sécurisé HPC4Health, désormais utilisé par des chercheur·euse·s et des clinicien·ne·s dans plusieurs hôpitaux ontariens. Il s’agit d’une collaboration entre le C3G et Calcul Québec.
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